雙序列密碼子比對工具能夠用最優(yōu)化的方式比對兩個序列。比對所用的打分矩陣來自于Schneider et al. (2005)。此雙序列密碼子比對工具用于查找保守編碼區(qū)。只允許ACGTU作為合法堿基字符。
輸入第一序列或者FASTA格式序列,長度限定在6000以內(nèi)。
輸入第二序列或者FASTA格式序列,長度限定在6000以內(nèi)。
使用以下參數(shù)來指定如何得分排列。
* 序列前有跳配(Gap)得 6 5 4 3 2 1 0 -1 -2 -3 -4 -5 -6
* 序列中間有跳配(Gap)得 6 5 4 3 2 1 0 -1 -2 -3 -4 -5 -6
* 序列后有跳配(Gap)得 6 5 4 3 2 1 0 -1 -2 -3 -4 -5 -6 分
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